随着我国家庭构成不断发生变化，有越来越多的非婚生子涌入社会，人民法院日益重视亲子关系的确认和认定，并采取一定的措施。那么，合肥在哪个司法机构可以办理非婚生子亲子鉴定呢？

首先讲的是，非婚生子法院是否需要做亲子鉴定。根据最高人民法院《关于办理认定、变更、撤销非婚生子亲子关系案件若干问题的规定》（以下简称《最高法》）第四十三条规定：“当事人因认定非婚生子亲子关系需要提起诉讼时，可以向人民法院提起认定行为担保请求，由人民法院作出裁定。”《最高法》第四十条和第四十一条规定：“当事人就亲子关系的确定、变更或撤销向人民法院提起请求的，由人民法院可以接受，应当予以受理；请求互相确认或否认亲子关系的，具有质疑意图的一方，应当向人民法院提交检验材料，由人民法院适用法定程序确定亲子关系。”这说明，当涉及非婚生子亲子关系认定或变更时，非婚生子法院必须做亲子鉴定，以明确和确定亲子关系。

其次，非婚生子女是否需要做亲子鉴定才能起诉。根据《最高法》第三十一条的规定，“非婚生子要起诉前，必须提供鉴定合格的亲子关系证明书”。

最后，在合肥市哪个司法鉴定机构可以办理非婚生子亲子鉴定。合肥市司法鉴定中心是一家专业从事法院鉴定和其他司法鉴定服务的国家批准的司法鉴定机构。该中心全面、重要的技术实力，符合公安部、司法部和财政部关于司法鉴定服务能力和技术水平标准，并获得《司法鉴定能力鉴定认证证书》。中心是中国科学院人类遗传学中心和湖北省司法鉴定中心的合作伙伴，在亲子鉴定方面有着丰富的临床实践经验和强大的技术实力，可以为司法机关提供全面及时的服务。

总之，合肥市司法鉴定中心可以为司法机关提供非婚生子亲子鉴定服务。非婚生子法院必须要做亲子鉴定来确定亲子关系，非婚生子起诉前也必须提供鉴定合格的亲子关系证明书。