合肥怀孕期间的亲子鉴定是一项比较重要的检查，可以帮助父母了解自己孩子发育情况，以便早日采取有效的预防措施。那么，怀孕期间的亲子鉴定要在哪里做呢？

首先，合肥市的亲子鉴定可以在安徽省合肥市的一批三甲医院做。比如合肥市第三人民医院，安徽省医院，安徽大学附属第一医院等。其中，第三人民医院和安徽大学附属第一医院都设有亲子鉴定中心，可以为孕妇或新生儿提供亲子鉴定服务，也可以基于社会行为和用药监测等来给予一站式全面的检测服务。

其次，孕妇怀孕期间也可以去合肥市一些私立妇科或儿科医院做亲子鉴定服务，这里不仅可以提供孕妇孕期检查，还可以提供亲子鉴定服务。不过，孕妇在进行亲子鉴定检查的时候，也应注意挑选正规的医院和具有资质的医师，确保护理质量。

另外，有些刚怀孕的女性其实也可以做亲子鉴定，具体的检测内容可以根据实际情况安排，比如超声检查，胎儿染色体常规检测，胎儿抗体检测，胎儿染色体正常图谱检测等。

总而言之，合肥怀孕期间亲子鉴定可以在安徽省合肥市的均能三甲医院、一些私立妇产科或儿科医院以及一些专业鉴定中心和科室做，同时也可以根据刚怀孕的孕妇的实际情况进行检查。但无论如何，最关键的是要找到正规的机构，选择具备资质的医师，确保保质保量。