随着南京社会的快速发展和变迁，犯罪亲子鉴定的需求也在大增，特别是现在很多未婚父母分别出现意外时，就要求犯罪亲子鉴定来证明双方的责任，这就对办理犯罪亲子鉴定证明提出了更高的要求。因此，在南京选择正规的机构办理犯罪亲子鉴定证明变得尤为重要，那么南京应该如何选择正规机构呢?

首先，在选择正规机构办理犯罪亲子鉴定证明时，应先确认服务机构是否真正具有合法资质，例如经江苏省司法厅批准设立的非政府性依法可办理犯罪亲子鉴定证明的机构，其中就包括南京市太平人民医院，泰州精准医学研究院，苏州民政科学研究院，南京九叔法医科技研究院等。

其次，在选择正规机构办理犯罪亲子鉴定证明的时候，还需要考虑服务机构的专业水平，比如服务机构是否有经验丰富的专家队伍，以及有无符合国家检测标准的专业设备，等，这样才能保证可靠性和准确性。

此外，做犯罪亲子鉴定的正规机构也需要严格遵守国家相关的规定，例如严禁超范围收费，严禁以任何方式隐瞒客户的信息，同时要履行严谨的服务承诺，为客户提供优质的服务。

总而言之，在南京选择正规机构办理犯罪亲子鉴定证明需要对服务机构进行多重考虑，而目前最为受客户欢迎的机构要数南京市太平人民医院，泰州精准医学研究院以及苏州民政科学研究院了，这些机构都拥有专业的团队和设备，并且均已取得正规认证并可以按照国家标准进行检测，有保障且受到公众的亲睐与认可。因此，如果在南京想办理犯罪亲子鉴定，可以优先考虑上述3家机构。