南京父子关系亲子鉴定都有哪些方法呢？我们可以通过亲子鉴定来鉴定子女之间的血缘关系和判断是否有真正的亲子关系。那么，南京父子关系亲子鉴定都有哪些方法呢？

首先是比较DNA，这也是办理鉴定最常见的方法，它是通过比较DNA的相似性和与非相关人的相异性来判断亲子关系的。比较的流程一般为，先采集待鉴定男女及非相关人的血液或唾液细胞，然后用荧光原位杂交技术，根据实验原理以判断同一个人或不同人的，最终得到一组DNA序列及相似性值进行比对，以此来识别是否是父子关系。

此外，还有线索搜集法，指将双方的婚姻、出生和生养证明进行比对，以及现场勘验等比较法，即将双方在外表、口音、影像等现场勘验，把双方有关情况做比对，如脸型、体型、身高、语言习惯等，以此来确定是否是真的亲子关系。

再有就是示踪调查，又称为实地调查或实人调查，即由专业调查机构或为此专门聘请的调查员通过实地追踪双方的作息时间、步行路径和走访家庭、朋友、同学等，从而判断双方是否有父子关系。

此外，化验检查也是南京父子关系亲子鉴定时很常使用的一种方法。它是利用双方抽取的血液，通过相应的术语对双方血清（血浆）中的特异抗原-抗体系统和相关特异抗原分子做比较，以判断双方的父子关系。

最后还有神经生物学指标，也叫『神经生物学指标法』，这种方法是通过对亲子双方脑电图等人脑发放的神经信号活动，分析它们是否具有一致性，以此来识别被鉴定者真正的亲属关系。

总之，上述几种方法可以作为南京父子关系亲子鉴定的方法，我们可以根据不同情况选择合适的方法去验证父子关系。父子关系亲子鉴定过程中很重要的是要紧密地按照规定和要求去做，才能确保所得出的测试��果的客观性和公正性。